四川花萼山国家级自然保护区管委会高度重视校地科研合作，先后与成都大熊猫繁育研究基地、西南大学、南京环科所、西华师范大学、重庆师范大学、四川文理学院等科研院所就本底资源调查、生物多样性监测、自然科普教育、保护区人才培养、科研基地共建、生态旅游规划、科考报告编制等事项进行深入交流，校地合作“硕果满枝”，呈现出“双向奔赴”新趋势。
创新科考模式。保护区与成都大熊猫繁育研究基地首次联合成功穿越保护区核心区，翻越海拔1800米的花萼山主脊线，针对保护区国家一级重点保护野生动物林麝开展专项调查，旨在深入了解林麝栖息环境、种群数量及分布情况，为保护花萼山这一“明星”物种建立科学档案。
深挖合作空间。保护区与西南大学、南京环科所、重庆师范大学、西华师范大学和四川文理学院通过实地调研和相互走访座谈交流，进一步挖掘校地合作新方式，达成合作意向，保护区可利用高校的科研资源、人才、技术、智力支持，进行生物多样性研究、生态保护、环境监测、大样地群落调查、实验基地建设等，同时为高校师生提供实践基地，促进学生实地研学，提升保护区科研水平和教育质量。
实现双向共赢。花萼山国家级自然保护区作为川东北唯一一个国家级自然保护区，被誉为大巴山“生物基因库”和“物种避难所”，为科研院所提供了理想的试验研究基地。同时，高校的科研成果也反哺于保护区，为保护区的可持续发展提供科学依据。这种合作模式有助于培养更多的人才，推动保护区绿色发展，实现保护区与高校双向共赢。
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